medparasitologyМедицинская паразитология и паразитарные болезниMedical Parasitology and Parasitic Diseases0025-83262713-1777Научно-образовательный паразитологический центр им. П.Г. Сергиева10.33092/0025-8326mp2023.3.3-8EYDJVHmedparasitology-100Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESBыявление трансмиссивных патогенов в клещах Ixodes persulcatus (Sch.,1930) из национального парка «Алханай»Detection of tick-borne pathogens in Ixodes persulcatus (Sch., 1930) from national park “Alkhanai”МельниковаО. В.Mel’nikovaO. V.

Иркутск

Irkutsk

АдельшинР. В.Adel’shinR. V.

Иркутск

Irkutsk

ЛопатовскаяК. В.LopatovskayaK. V.

Иркутск

Irkutsk

ТрушинаЮ. Н.TrushinaYu. N.

п. Бохан, Иркутская обл.

Bokhan settlement, Irkutsk region

БондарюкА. Н.BondaryukA. N.

Иркутск

Irkutsk

ГаранинаЕ. А.GaraninaE. A.

г. Чита

Chita

МашуковаЛ. М.MashukovaL. M.

г. Чита

Chita

ТурановА. О.TuranovA. O.

г. Чита

Chita

АндаевЕ. И.AndaevE. I.

Иркутск

Irkutsk

ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт РоспотребнадзораРоссияIrkutsk Anti-Plague Research Institute of Siberia and the Far EastRussian FederationФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора; ФГБОУ ВО Иркутский государственный университетРоссияIrkutsk Anti-Plague Research Institute of Siberia and the Far East; Irkutsk State UniversityRussian FederationКДЛ ОГБУЗ Боханская районная больницаРоссияBokhan district hospitalRussian FederationФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Забайкальском крае»РоссияCenter of Hygiene and Epidemiology in the Trans-Baikal TerritoryRussian Federation2023050520260338Copyright © Научно-образовательный паразитологический центр им. П.Г. Сергиева, 20262026Научно-образовательный паразитологический центр им. П.Г. СергиеваНаучно-образовательный паразитологический центр им. П.Г. Сергиеваhttps://www.medparasitology.com/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.medparasitology.com/jour/article/view/100

Приведены результаты исследования взрослых голодных иксодовых клещей (Ixodes persulcatus), собранных на флаг на территории национального парка «Алханай» (Забайкальский край, Дульдургинский район), на спектр трансмиссивных патогенов. Антиген вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) выявляли с помощью иммуноферментного анализа (ИФА). Генетические маркеры анаплазм, боррелий и эрлихий детектировали в ПЦР в реальном времени с набором реагентов «АмплиСенс® TBEV, B. burgdorferi s.l., A. phagocytophilum, E.chaffeensis/E. muris-FL». Вирусофорность по результатам ИФА составила 0,9 %. При исследовании суспензий в ПЦР маркеры одного или более патогенов обнаружены в 49,8 % из них. Генетический материал боррелий выявлен в 31,1 % случаев, эрлихий и анаплазм – в 13,5 % и 12,6 % проб соответственно, РНК ВКЭ – в 1,7 % суспензий. От двух до четырёх одновременно встречалось в 14,7 % суспензий в восьми различных вариантах коинфицирования. Наиболее часто в одном клеще встречались боррелии в сочетании с анаплазмами и эрлихиями. В то же время, боррелии чаще встречались в моноварианте, чем в сочетаниях. Генотипирование боррелий показало циркуляцию трёх их патогенных видов: B. afzelii и B. garinii и B. miyamotoi, а ВКЭ – Байкальского его субтипа.

The results of adult taiga ticks study (Ixodes persulcatus), flagged in the national park “Alkhanai” (Zabaikalsky Krai, Duldurginsky district), for the range of tick-borne pathogens was held. ELISA detected the tickborne encephalitis virus (TBEV) antigen. Genetic markers of Anaplasma, Borrelia and Ehrlichia were detected by real-time PCR, using the kit «AmpliSens® TBEV, B. burgdorferi s.l., A. phagocytophilum, E.chaffeensis/E. muris-FL». Virus prevalence according ELISA results reached 0.9 %. PCR revealed at least two pathogen in 49.8 % of ticks. Genetic markers of Borrelia were found in 31.1 % of cases, Ehrlichia and Anaplasma – in 13.5 % and 12.6 % occured samples respectively, TBEV RNA – in 1.7 % of ticks’ suspensions. From to four pathogens in one tick in 14.7 % of samples in eight different variants of co-infection. The most often variants were Borrelia with Anaplasma and Ehrlichia. At the same time, Borrelia more often was detected as single pathogen. The genotyping of Borrelia have shown the circulation of three pathogenic species on the territory: B. afzelii и B. garinii и B. miyamotoi. The genotyping of TBEV revealed the Baikalian subtype of the virus.

таёжный клещIxodes persulcatusанаплазмыборрелииэрлихиивирус клещевого энцефалитаЗабайкальский крайthe taiga tickIxodes persulcatusAnaplasmaBorreliaEhrlichiatick-borne encephalitis virusZabaikalsky KraiReferencesКуриленко А.В., Ядрищенская Н. Г., Лиханов В.Д. и др. Государственная геологическая карта Российской Федерации масштаба 1:200000. Серия Даурская. Лист M-49-XII (Курорт Дарасун). Москва: МФ ВСЕГЕИ, 2019.Kurilenko A.V., Yadrishchenskaya N.G., Lihanov V.D. et al. State geological map of Russian Federation scale 1:200000. Sweries Daurian. Leaf M-49-XII (resort Darasun). Moscow, 2019 (in Russian)].Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В. Районирование ареала клещевого энцефалита. Итоги науки и техники. Сер. Медицинская география, М., 1981; 11.Korenberg E.I., Kovalevskij Yu.V. Zoning of tick-borne encephalitis virus area. Science and technology. Series “Medical geography”, Moscow, 1981;11. (in Russian).Носков А.К., Никитин А.Я., Андаев Е.И. и др. Клещевой вирусный энцефалит в Российской Федерации: особенности эпидемического процесса в период устойчивого спада заболеваемости, эпидемиологическая ситуация в 2016 г., прогноз на 2017 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2017;1:37–43. DOI: 10.21055/0370-1069-2017-1-37-43.Noskov A.K., Nikitin A.Ya., Andaev E.I. et al. Tick-borne virus encephalitis in the Russian Federation: features of epidemic process in steady morbidity decrease period. Epidemiological condition in 2016 and the forecast for 2017. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2017;1:37-43 (in Russian) DOI: 10.21055/0370-1069-2017-1-37-43.Богданов И.И. Особо охраняемые природные территории и проблемаприродно-очаговых болезней. Современные аспекты природной очаговости болезней: матер. Всеросс. конф. с междунар. участием, посвящ. 90-летию ФБУН «Омский научно-исследовательский институт природноочаговых инфекций» Роспотребнадзора (1–2 ноября 2011 г., Омск), Омск: ИЦ «Омский научный вестник», 2011:137-138.Bogdanov I.I. Special protected natural areas and the problem of natural-foci infections. Modern aspects of natural focality of infections: proceedings of the Conference with international participation. Omsk, 2011:137-138. (in Russian)]Филиппова Н.А. Иксодовые клещи подсем. Ixodinae (Фауна СССР. Паукообразные; IV (4)). Л., Наука, 1977. 396 с.Filippova N.A. Ixodid ticks of subfamily Ixodinae (Fauna of USSR. Arachnoidea IV (4). Leningrad “Nauka”, 1977. 396 p. (in Russian).Adelshin R.V., Sidorova E.A., Bondaryuk A.N., et al. “886-84-like” tick-borne encephalitis virus strains: Intraspecific status elucidated by comparative genomics. Ticks and Tick-borne Diseases. 2019;10(5):1168-1172; DOI: 10.1016/j.ttbdis.2019.06.006Adelshin R.V., Sidorova E.A., Bondaryuk A.N., et al. “886-84-like” tick-borne encephalitis virus strains: Intraspecific status elucidated by comparative genomics. Ticks and Tick-borne Diseases. 2019;10(5):1168-1172; DOI: 10.1016/j.ttbdis.2019.06.006Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. 1999. Nucleic Acids Symposium Series, 41: 95–98.Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. 1999. Nucleic Acids Symposium Series, 41: 95–98.Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М., Мир, 1984. 480 с.T. Maniatis, E.F. Fritsch, J. Sambrook. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory, 1982. 545 p.(in Russian).Katoh K., Standley D.M. MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability. Mol Biol Evol. 2013;30(4):772-780. DOI: 10.1093/molbev/mst010.Katoh K., Standley D.M. MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability. Mol Biol Evol. 2013;30(4):772-780. DOI: 10.1093/molbev/mst010.Nguyen L.T., Schmidt H.A., von Haeseler A., Minh B.Q. IQ-TREE: a fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum-likelihood phylogenies. Mol. Biol. Evol. 2015;32(1):268-274. DOI: 10.1093/molbev/msu300Nguyen L.T., Schmidt H.A., von Haeseler A., Minh B.Q. IQ-TREE: a fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum-likelihood phylogenies. Mol. Biol. Evol. 2015;32(1):268-274. DOI: 10.1093/molbev/msu300Kalyaanamoorthy S., Minh B.Q., Wong T.K.F. et al. ModelFinder: fast model selection for accurate phylogenetic estimates // Nat. Methods. 2017;14(6):587-589. DOI: 10.1038/nmeth.4285Kalyaanamoorthy S., Minh B.Q., Wong T.K.F. et al. ModelFinder: fast model selection for accurate phylogenetic estimates // Nat. Methods. 2017;14(6):587-589. DOI: 10.1038/nmeth.4285Yu G. Using ggtree to Visualize Data on Tree-Like Structures // Curr Protoc Bioinformatics. 2020;69(1):e96. DOI: 10.1002/cpbi.96.Yu G. Using ggtree to Visualize Data on Tree-Like Structures // Curr Protoc Bioinformatics. 2020;69(1):e96. DOI: 10.1002/cpbi.96.Rozewicki J., Li S., Amada K.M., et al. MAFFT-DASH: integrated protein sequence and structural alignment // Nucleic Acids Res 2019;47:W5-W10. DOI:10.1093/nar/gkz342.Rozewicki J., Li S., Amada K.M., et al. MAFFT-DASH: integrated protein sequence and structural alignment // Nucleic Acids Res 2019;47:W5-W10. DOI:10.1093/nar/gkz342.Дампилова И.Г., Туранов А.О. Вопросы эпидемиологического надзора за клещевым энцефалитом в Забайкальском крае. Национальные приоритеты России. 2014;3(13):33-36.Dampilova I.G., Turanov A.O. Epidemiological surveillance of tick-borne encephalitis in Transbaikalian Region. National priorities of Russia. 2014;3(13):33-36. (in Russian).Носков А.К., Трушина Ю.Н., Туранов А.О. и др. Клинико-эпидемиологические особенности иксодовых клещевых боррелиозов в Забайкальском крае. Проблемы особо опасных инфекций. 2014;4:25-28.Noskov A.K., Trushina Yu.N., Turanov A.O. at al. Clinical-Epidemiological Peculiarities of the Tick-Borne Borrelioses Registered in the Trans-Baikal Territory. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2014;4:25-28. (in Russian)].Андаев Е.И., Сидорова Е.А., Борисова Т.И. и др. Клещевой энцефалит в Забайкальском крае и молекулярно-биологическая характеристика возбудителя. Современные аспекты природной очаговости болезней. Матер. Всеросс. конф. с междунар. участием, посвящ. 90-летию ФБУН «Омский научно-исследовательский институт природноочаговых инфекций» Роспотребнадзора (1–2 ноября 2011 г., Омск) / Омск: ИЦ «Омский научный вестник», 2011; 148-149.Andaev E.I., Sidorova E.A., Borisova T.I. et al. Tick-borne encephalitis in Transbaikalian Region and molecular biological characteristics of the pathogen. Modern aspects of natural focality of infections: proceedings of the Conference with international participation. Omsk, 2011:148-149. (in Russian).Козлова И.В., Демина Т.В., Ткачев С.Е. и др. Характеристика байкальского субтипа вируса клещевого энцефалита, циркулирующего на территории Восточной Сибири. Acta Biomedica Scientifica. 2018;3(4):53-60. https://doi.org/10.29413/ABS.2018-3.4.9Kozlova I.V., Demina T.V., Tkachev S.E. et al. Characteristics of the Baikal subtype of tick-borne encephalitis virus circulating in eastern Siberia. Acta Biomedica Scientifica. 2018;3(4):53-60. (in Russian) https://doi.org/10.29413/ABS.2018-3.4.9

The authors declare that there are no conflicts of interest present.