medparasitologyМедицинская паразитология и паразитарные болезниMedical Parasitology and Parasitic Diseases0025-83262713-1777Научно-образовательный паразитологический центр им. П.Г. Сергиева10.33092/0025-8326mp2024.3.3-9ZVGTUOmedparasitology-45Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESМетагеномный анализ вирома комаров Aedes (Stegomyia) albopictus skus. Черноморского побережья КавказаMetagenomic analysis of viromes of Aedes (Stegomyia) albopictus skus. mosquitoes оf the Black sea coast of the CaucasusАльховскийС. В.AlkhovskyS. V.

г. Москва

Moscow

ВишневскаяТ. В.VishnevskayaT. V.

г. Москва

Moscow

ВышемирскийО. И.VyshemirskyO. I.

г. Сочи

Sochi

ГанушкинаЛ. А.GanushkinaL. A.

г. Москва

Moscow

ЛеншинС. В.LenshinS. V.

г. Ставрополь

Stavropol

ПатраманИ. В.PatramanI. V.

г. Москва

Moscow

ЧебышевН. В.ChebyshevN. V.

г. Москва

Moscow

ФГБУ "Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи" Минздрава РоссииN.F.Gamaleya Federal Research Centre of Epidemiology and MicrobiologyКурчатовский комплекс медицинской приматологии НИЦ «Курчатовский институт»Kurchatov Complex of Medical Primatology, National Research Center “Kurchatov Institute”ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет)Sechenov First Moscow State Medical UnivesityСочинское противочумное отделение ФКУЗ Ставропольский противочумный институт РоспотребнадзораSochi anti-plague department of the FKUZ Stavropol Anti-plague Institute Rospotrebnadzor2024280420260339Copyright © Научно-образовательный паразитологический центр им. П.Г. Сергиева, 20262026Научно-образовательный паразитологический центр им. П.Г. СергиеваНаучно-образовательный паразитологический центр им. П.Г. Сергиеваhttps://www.medparasitology.com/jour/about/submissions#copyrightNoticehttps://www.medparasitology.com/jour/article/view/45

Целью работы было выявление методом метагеномного секвенирования de novo вирусов, содержащихся в самках комаров Ae. albopictus. Сборы комаров проводили стандартными энтомологическими методами в августе 2018 года на Кубани в Туапсе, Адлере, на территории Адлерского питомника обезьян и в г. Гагра, Абхазия. Имаго определяли по морфологическим признакам. Всего отловили 1336 комаров. Сформировали четыре пула по месту сбора от 300 до 400 экземпляров в каждом. Вирус считался обнаруженным, если в пробе комаров выявляли специфическую нуклеотидную последовательность не менее 1000 оснований. Всего выявили 8 вирусов насекомых. Четыре вируса классифицированы и относятся к семействам Rhabdoviridae, Orthomyxoviridae, Chuviridae. Семейства других четырех вирусов еще не определены, но два вируса отнесены к порядку Bunyavirales. Вирусы патогенные для человека не обнаружены.

The aim of the study was to identify viruses contained in female Ae. albopictus mosquitoes using de novo metagenomic sequencing. Mosquitoes were collected using standard entomological methods in August 2019 in the Kuban in Tuapse, Adler, on the territory of the Adler Monkey Nursery and in the city of Gagra, Abkhazia. Adults were identified by morphological characteristics. A total of 1,336 mosquitoes were caught. We formed four pools at the collection site, with 300 to 400 specimens in each. The virus was considered detected if a specific nucleotide sequence of at least 1000 bases was detected in the mosquito sample. A total of 8 insect viruses were identified. Four viruses are classified and belong to the families Rhabdoviridae, Orthomyxoviridae, Chuviridae. The families of the other four viruses have not yet been determined, but two viruses are classified in the order Bunyavirales. No viruses pathogenic for humans were detected.

виромAe. albopictusметагеномное секвенированиеКраснодарский крайРеспублика АбхазияviromeAe. albopictusmetagenomic sequencingKrasnodar regionRepublic of AbkhaziaReferencesГанушкина Л.А., Таныгина Е.Ю., Безжонова О.В., Сергиев В.П. Об обнаружении комаров Aedes (stegomyia) albopictus skus. на территории Российской Федерации // Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2011; 1: 3-4. EDN: UNCJHDGanushkina L.A., Tanygina E.YU., Bezhonova O.V., Sergiev V.P. On the detection of Aedes (stegomyia) albopictus skus. mosquitoes on the territory of the Russian Federation // Med. parazitol. 2011; 1: 3-4. (in Russian)Федорова М.В., Швец О.Г., Патраман И.В., Медяник И.М., Отставнова А.Д., Леншин С.В., Вышемирский О.И. Завозные виды комаров на Черноморском побережье Кавказа: современные ареалы. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2019; 1: 47-55. EDN: XLPPDY.Fedorova M.V., Shvez O.G., Patraman I.V., Medyanik I.M., Otstavnova A.D., Lenshin S.V., Vyshemirsky O.I. Invasive mosquito species of the Black sea coast of the caucasus: current ranges // Med. parazitol. 2019; 1: 47-55. (in Russian) DOI: 10.33092/0025-8326mp2019.1.47-55.Коваленко И.С., Якунин С.Н., Абибулаев Д.Э., Владычак В.В., Бородай Н.В., Смелянский В.П., Фомина В.К., Зинич Л.С., Тихонов С.Н. Обнаружение Aedes (Stegomyia) albopictus (Skuse, 1895) в Крыму // Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 2: 135-137. EDN: JPQXGK.Kovalenko I.S., Yakunin S.N., Abibulaev D.E., Vladychak V.V., Boroday N.V., Smelyansky V.P., Fomina V.K., Zinich L.S., Tikhonov S.N. Reporting of Aedes (Stegomyia) albopictus (Skuse, 1895) in the Territory of Crimea // Problems of Particularly Dangerous Infections. 2020; 2: 135-137 (in Russian) DOI:10.21055/0370-1069-2020-2-135-137.Schoch C.L., Ciufo S., Domrachev M., Hotton C.L., Kannan S., Khovanskaya R., Leipe D., Mcveigh R., O'Neill K., Robbertse B., Sharma S., Soussov V., Sullivan J.P., Sun L., Turner S., Karsch-Mizrachi I. NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools // Database (Oxford). 2020; 1; 2020: baaa062. DOI: 10.1093/database/baaa062.Schoch C.L., Ciufo S., Domrachev M., Hotton C.L., Kannan S., Khovanskaya R., Leipe D., Mcveigh R., O'Neill K., Robbertse B., Sharma S., Soussov V., Sullivan J.P., Sun L., Turner S., Karsch-Mizrachi I. NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools // Database (Oxford). 2020; 1; 2020: baaa062. DOI: 10.1093/database/baaa062.Andrade P.S., Valença I.N., Heinisch M.R.S., Rocha E.C., Fernandes L.N., Faria N.R., Sabino E.C., Lima-Camara T.N. First Report of Wenzhou sobemo-like virus 4 in Aedes albopictus (Diptera: Culicidae) in Latin America // Viruses. 2022; 14(11): 2341. DOI: 10.3390/v14112341.Andrade P.S., Valença I.N., Heinisch M.R.S., Rocha E.C., Fernandes L.N., Faria N.R., Sabino E.C., Lima-Camara T.N. First Report of Wenzhou sobemo-like virus 4 in Aedes albopictus (Diptera: Culicidae) in Latin America // Viruses. 2022; 14(11): 2341. DOI: 10.3390/v14112341.Li C.X., Shi M., Tian J.H., Lin X.D., Kang Y.J., Chen L.J., Qin X.C., Xu J., Holmes E.C., Zhang Y.Z. Unprecedented genomic diversity of RNA viruses in arthropods reveals the ancestry of negative-sense RNA viruses // eLife. 2015; 4: e05378. DOI: 10.7554/eLife.05378.Li C.X., Shi M., Tian J.H., Lin X.D., Kang Y.J., Chen L.J., Qin X.C., Xu J., Holmes E.C., Zhang Y.Z. Unprecedented genomic diversity of RNA viruses in arthropods reveals the ancestry of negative-sense RNA viruses // eLife. 2015; 4: e05378. DOI: 10.7554/eLife.05378.Электронный ресурс: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KX898491.1?report=genbank (дата обращения 07.07.2024).Электронный ресурс: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KX898491.1?report=genbank (дата обращения 07.07.2024).Ergünay K., Brinkmann A., Litzba N., Günay F., Kar S., Öter K., Örsten S., Sarıkaya Y., Alten B., Nitsche A., Linton Y.M. A novel rhabdovirus, related to Merida virus, in field-collected mosquitoes from Anatolia and Thrace // Arch Virol. 2017; 162(7): 1903-1911. DOI 10.1007/s00705-017-3314-4.Ergünay K., Brinkmann A., Litzba N., Günay F., Kar S., Öter K., Örsten S., Sarıkaya Y., Alten B., Nitsche A., Linton Y.M. A novel rhabdovirus, related to Merida virus, in field-collected mosquitoes from Anatolia and Thrace // Arch Virol. 2017; 162(7): 1903-1911. DOI 10.1007/s00705-017-3314-4.Электронный ресурс: https://gold.jgi.doe.gov/organism?id=Go0333108 (дата обращения 07.07.2024).Электронный ресурс: https://gold.jgi.doe.gov/organism?id=Go0333108 (дата обращения 07.07.2024).Sanborn M.A., Klein T.A., Kim H.C., Fung C.K., Figueroa K.L., Yang Y., Asafo-Adjei E.A., Jarman R.G., Hang J. Metagenomic Analysis Reveals Three Novel and Prevalent Mosquito Viruses from a Single Pool of Aedes vexans nipponii Collected in the Republic of Korea // Viruses. 2019; 11(3): 222. DOI: 10.3390/v11030222.Sanborn M.A., Klein T.A., Kim H.C., Fung C.K., Figueroa K.L., Yang Y., Asafo-Adjei E.A., Jarman R.G., Hang J. Metagenomic Analysis Reveals Three Novel and Prevalent Mosquito Viruses from a Single Pool of Aedes vexans nipponii Collected in the Republic of Korea // Viruses. 2019; 11(3): 222. DOI: 10.3390/v11030222.Леншин С.В., Патраман И.В., Альховский С.В., Вышемирский О.И Вирусные инфекции, переносимые комарами, - риски возникновения аутохтонных случаев заболевания в Краснодарском крае (систематический обзор) // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2021; 20(3): 129-138. EDN: VWPRGQLenshin S.V., Patraman I.V., Alkhovsky S.V., Vyshemirsky O.I. Mosquito-borne viral infections in the Krasnodar territory ~ risks of autochthonous cases of the disease // Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2021; 20(3): 129-138. (in Russian) DOI: 10.31631/2073-3046-2021-20-3-129-138.Bohers C., Vazeille M., Bernaoui L., Pascalin L., Meignan K., Mousson L., Jakerian G., Karch A., de Lamballerie X., Failloux A.B. Aedes albopictus is competent vector of five arboviruses affecting human health, greater Paris, France, 2023 // Euro Surveill. 2024; 29(20): 2400271. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2024.29.20.2400271.Bohers C., Vazeille M., Bernaoui L., Pascalin L., Meignan K., Mousson L., Jakerian G., Karch A., de Lamballerie X., Failloux A.B. Aedes albopictus is competent vector of five arboviruses affecting human health, greater Paris, France, 2023 // Euro Surveill. 2024; 29(20): 2400271. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2024.29.20.2400271.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.