Bыявление трансмиссивных патогенов в клещах Ixodes persulcatus (Sch.,1930) из национального парка «Алханай»

Приведены результаты исследования взрослых голодных иксодовых клещей (Ixodes persulcatus), собранных на флаг на территории национального парка «Алханай» (Забайкальский край, Дульдургинский район), на спектр трансмиссивных патогенов. Антиген вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) выявляли с помощью иммуноферментного анализа (ИФА). Генетические маркеры анаплазм, боррелий и эрлихий детектировали в ПЦР в реальном времени с набором реагентов «АмплиСенс® TBEV, B. burgdorferi s.l., A. phagocytophilum, E.chaffeensis/E. muris-FL». Вирусофорность по результатам ИФА составила 0,9 %. При исследовании суспензий в ПЦР маркеры одного или более патогенов обнаружены в 49,8 % из них. Генетический материал боррелий выявлен в 31,1 % случаев, эрлихий и анаплазм – в 13,5 % и 12,6 % проб соответственно, РНК ВКЭ – в 1,7 % суспензий. От двух до четырёх одновременно встречалось в 14,7 % суспензий в восьми различных вариантах коинфицирования. Наиболее часто в одном клеще встречались боррелии в сочетании с анаплазмами и эрлихиями. В то же время, боррелии чаще встречались в моноварианте, чем в сочетаниях. Генотипирование боррелий показало циркуляцию трёх их патогенных видов: B. afzelii и B. garinii и B. miyamotoi, а ВКЭ – Байкальского его субтипа.

1. Куриленко А.В., Ядрищенская Н. Г., Лиханов В.Д. и др. Государственная геологическая карта Российской Федерации масштаба 1:200000. Серия Даурская. Лист M-49-XII (Курорт Дарасун). Москва: МФ ВСЕГЕИ, 2019.

2. Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В. Районирование ареала клещевого энцефалита. Итоги науки и техники. Сер. Медицинская география, М., 1981; 11.

3. Носков А.К., Никитин А.Я., Андаев Е.И. и др. Клещевой вирусный энцефалит в Российской Федерации: особенности эпидемического процесса в период устойчивого спада заболеваемости, эпидемиологическая ситуация в 2016 г., прогноз на 2017 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2017;1:37–43. DOI: 10.21055/0370-1069-2017-1-37-43.

4. Богданов И.И. Особо охраняемые природные территории и проблемаприродно-очаговых болезней. Современные аспекты природной очаговости болезней: матер. Всеросс. конф. с междунар. участием, посвящ. 90-летию ФБУН «Омский научно-исследовательский институт природноочаговых инфекций» Роспотребнадзора (1–2 ноября 2011 г., Омск), Омск: ИЦ «Омский научный вестник», 2011:137-138.

5. Филиппова Н.А. Иксодовые клещи подсем. Ixodinae (Фауна СССР. Паукообразные; IV (4)). Л., Наука, 1977. 396 с.

6. Adelshin R.V., Sidorova E.A., Bondaryuk A.N., et al. “886-84-like” tick-borne encephalitis virus strains: Intraspecific status elucidated by comparative genomics. Ticks and Tick-borne Diseases. 2019;10(5):1168-1172; DOI: 10.1016/j.ttbdis.2019.06.006

7. Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. 1999. Nucleic Acids Symposium Series, 41: 95–98.

8. Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. М., Мир, 1984. 480 с.

9. Katoh K., Standley D.M. MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability. Mol Biol Evol. 2013;30(4):772-780. DOI: 10.1093/molbev/mst010.

10. Nguyen L.T., Schmidt H.A., von Haeseler A., Minh B.Q. IQ-TREE: a fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum-likelihood phylogenies. Mol. Biol. Evol. 2015;32(1):268-274. DOI: 10.1093/molbev/msu300

11. Kalyaanamoorthy S., Minh B.Q., Wong T.K.F. et al. ModelFinder: fast model selection for accurate phylogenetic estimates // Nat. Methods. 2017;14(6):587-589. DOI: 10.1038/nmeth.4285

12. Yu G. Using ggtree to Visualize Data on Tree-Like Structures // Curr Protoc Bioinformatics. 2020;69(1):e96. DOI: 10.1002/cpbi.96.

13. Rozewicki J., Li S., Amada K.M., et al. MAFFT-DASH: integrated protein sequence and structural alignment // Nucleic Acids Res 2019;47:W5-W10. DOI:10.1093/nar/gkz342.

14. Дампилова И.Г., Туранов А.О. Вопросы эпидемиологического надзора за клещевым энцефалитом в Забайкальском крае. Национальные приоритеты России. 2014;3(13):33-36.

15. Носков А.К., Трушина Ю.Н., Туранов А.О. и др. Клинико-эпидемиологические особенности иксодовых клещевых боррелиозов в Забайкальском крае. Проблемы особо опасных инфекций. 2014;4:25-28.

16. Андаев Е.И., Сидорова Е.А., Борисова Т.И. и др. Клещевой энцефалит в Забайкальском крае и молекулярно-биологическая характеристика возбудителя. Современные аспекты природной очаговости болезней. Матер. Всеросс. конф. с междунар. участием, посвящ. 90-летию ФБУН «Омский научно-исследовательский институт природноочаговых инфекций» Роспотребнадзора (1–2 ноября 2011 г., Омск) / Омск: ИЦ «Омский научный вестник», 2011; 148-149.

17. Козлова И.В., Демина Т.В., Ткачев С.Е. и др. Характеристика байкальского субтипа вируса клещевого энцефалита, циркулирующего на территории Восточной Сибири. Acta Biomedica Scientifica. 2018;3(4):53-60. https://doi.org/10.29413/ABS.2018-3.4.9