Метагеномный анализ вирома комаров Aedes (Stegomyia) albopictus skus. Черноморского побережья Кавказа

Целью работы было выявление методом метагеномного секвенирования de novo вирусов, содержащихся в самках комаров Ae. albopictus. Сборы комаров проводили стандартными энтомологическими методами в августе 2018 года на Кубани в Туапсе, Адлере, на территории Адлерского питомника обезьян и в г. Гагра, Абхазия. Имаго определяли по морфологическим признакам. Всего отловили 1336 комаров. Сформировали четыре пула по месту сбора от 300 до 400 экземпляров в каждом. Вирус считался обнаруженным, если в пробе комаров выявляли специфическую нуклеотидную последовательность не менее 1000 оснований. Всего выявили 8 вирусов насекомых. Четыре вируса классифицированы и относятся к семействам Rhabdoviridae, Orthomyxoviridae, Chuviridae. Семейства других четырех вирусов еще не определены, но два вируса отнесены к порядку Bunyavirales. Вирусы патогенные для человека не обнаружены.

1. Ганушкина Л.А., Таныгина Е.Ю., Безжонова О.В., Сергиев В.П. Об обнаружении комаров Aedes (stegomyia) albopictus skus. на территории Российской Федерации // Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2011; 1: 3-4. EDN: UNCJHD

2. Федорова М.В., Швец О.Г., Патраман И.В., Медяник И.М., Отставнова А.Д., Леншин С.В., Вышемирский О.И. Завозные виды комаров на Черноморском побережье Кавказа: современные ареалы. Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2019; 1: 47-55. EDN: XLPPDY.

3. Коваленко И.С., Якунин С.Н., Абибулаев Д.Э., Владычак В.В., Бородай Н.В., Смелянский В.П., Фомина В.К., Зинич Л.С., Тихонов С.Н. Обнаружение Aedes (Stegomyia) albopictus (Skuse, 1895) в Крыму // Проблемы особо опасных инфекций. 2020; 2: 135-137. EDN: JPQXGK.

4. Schoch C.L., Ciufo S., Domrachev M., Hotton C.L., Kannan S., Khovanskaya R., Leipe D., Mcveigh R., O'Neill K., Robbertse B., Sharma S., Soussov V., Sullivan J.P., Sun L., Turner S., Karsch-Mizrachi I. NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools // Database (Oxford). 2020; 1; 2020: baaa062. DOI: 10.1093/database/baaa062.

5. Andrade P.S., Valença I.N., Heinisch M.R.S., Rocha E.C., Fernandes L.N., Faria N.R., Sabino E.C., Lima-Camara T.N. First Report of Wenzhou sobemo-like virus 4 in Aedes albopictus (Diptera: Culicidae) in Latin America // Viruses. 2022; 14(11): 2341. DOI: 10.3390/v14112341.

6. Li C.X., Shi M., Tian J.H., Lin X.D., Kang Y.J., Chen L.J., Qin X.C., Xu J., Holmes E.C., Zhang Y.Z. Unprecedented genomic diversity of RNA viruses in arthropods reveals the ancestry of negative-sense RNA viruses // eLife. 2015; 4: e05378. DOI: 10.7554/eLife.05378.

7. Электронный ресурс: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KX898491.1?report=genbank (дата обращения 07.07.2024).

8. Ergünay K., Brinkmann A., Litzba N., Günay F., Kar S., Öter K., Örsten S., Sarıkaya Y., Alten B., Nitsche A., Linton Y.M. A novel rhabdovirus, related to Merida virus, in field-collected mosquitoes from Anatolia and Thrace // Arch Virol. 2017; 162(7): 1903-1911. DOI 10.1007/s00705-017-3314-4.

9. Электронный ресурс: https://gold.jgi.doe.gov/organism?id=Go0333108 (дата обращения 07.07.2024).

10. Sanborn M.A., Klein T.A., Kim H.C., Fung C.K., Figueroa K.L., Yang Y., Asafo-Adjei E.A., Jarman R.G., Hang J. Metagenomic Analysis Reveals Three Novel and Prevalent Mosquito Viruses from a Single Pool of Aedes vexans nipponii Collected in the Republic of Korea // Viruses. 2019; 11(3): 222. DOI: 10.3390/v11030222.

11. Леншин С.В., Патраман И.В., Альховский С.В., Вышемирский О.И Вирусные инфекции, переносимые комарами, - риски возникновения аутохтонных случаев заболевания в Краснодарском крае (систематический обзор) // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2021; 20(3): 129-138. EDN: VWPRGQ

12. Bohers C., Vazeille M., Bernaoui L., Pascalin L., Meignan K., Mousson L., Jakerian G., Karch A., de Lamballerie X., Failloux A.B. Aedes albopictus is competent vector of five arboviruses affecting human health, greater Paris, France, 2023 // Euro Surveill. 2024; 29(20): 2400271. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2024.29.20.2400271.